Die Anton-Weilmaier-Schule kooperiert mit folgenden Schulen mit Schulprofil Inklusion im Landkreis Miesbach:
Grundschule Valley www.schule-valley.de
Mittelschule Miesbach www.ms-miesbach.de
An den beiden Regelschulen können Schülerinnen und Schüler mit sonderpädagogischem Förderbedarf aufgenommen werden, die im Schulsprengel leben. Sonderschullehrerinnen der Anton-Weilmaier-Schule betreuen bei Bedarf die Schülerinnen und Schüler und beraten die Lehrkräfte.